Нынешняя Русская и Украинская Православная церковь, которые находятся в каноническом единстве, насчитывают ок. 100 епархий. Одна из них - Харьк. и Богодуховская - возникла по указу императора Павла, подписанного 16 октября (ст. ст.) 1799. Харьк. епархия выделилась из более обширной Белгородской, которая существовала с XVII ст. До ее образования территория Харьк. слободско-украинского полка относилась к Патриаршей обл. За 200 лет существования епархии во главе ее стояли 29 архипастырей (см. список). Все они получили высшее богословское образование в одной из четырех духовных академий России и Украины (Санкт-Петербургской, Московской, Киевской или Казанской), имели практические навыки священнической деятельности, управляли монастырями, работали ректорами духовных семинарий и академий, состояли членами многочисленных церковных комитетов, советов, обществ, занимались миссионерской деятельностью, были викариями. Как правило, они имели ученые степени магистра и доктора богословия, состояли профессорами духовных учебных заведений. Харьк. владыки активно влияли на общецерковный ход дел. В епархии выходили журналы и газеты: «Духовный вестник» (1862– 1867), «Епархиальные ведомости» (1867–1884), «Благовест» (1882), «Вера и Разум» (1884–1917), «Церковная газета» (1906). Сложным в истории епархии были 1917–1991 годы; в 1922 Президиумом Губисколкома закрыты все монастыри, начавшие восстанавливаться в 1990-е. С 1946 она стала носить наименование Харьк. и Богодуховской (ранее Харьк. и Ахтырской, Слободско-Украинской). Хронологический указатель правящих Харьк. архипастырcкий:
Христофор (Харитон Семенович Сулима) - епископ Слободско-Украинский и Харьк. с 16 октября 1799 по 6 февраля 1813;
Аполлос (Тимофей Иванович Терешкевич) - епископ Слободско-Украинский и Харьк. с 14 октября 1813 по 19 января 1817;
Павел (Павел Кондратьевич Саббатовский) - епископ Слободско-Украинский и Харьк. с 17 февраля 1817 по 31 января 1826;
Виталий (Виталий Борисов-Жегачев) - епископ Слободско-Украинский и Харьк. с 28 февраля 1826 по 12 марта 1832;
Иннокентий (Илья Федорович Александров) - епископ Слободско-Украинский и Харьк. с 19 мая 1832 по 22 июня 1835;
Мелетий (Михаил Иванович Леонтович) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 22 июня 1835 по 29 февраля 1840;
Смарагд (Александр Крыжановский) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 6 апреля 1840 по 31 декабря 1841;
Иннокентий (Иоанн Александрович Борисов) - епископ Харьк. и Ахтырский с 31 декабря 1841 по 24 февраля 1848;
Елпидифор (Алексей Иванович Бенедиктов) - епископ Харьк. и Ахтырский с 10 марта 1848 по 6 ноября 1848;
Филарет (Дмитрий Григорьевич Гумилевский) - епископ Харьк. и Ахтырский с 6 ноября 1848 (архиепископ с 7 апреля 1857) по 2 мая 1859;
Макарий (Михаил Петрович Булгаков) - епископ Харьк. и Ахтырский со 2 мая 1859 (архиепископ с 1862) по 10 декабря 1868;
Нектарий (Николай Самойлович Надеждин) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 21 января 1859 по 7 сентября 1874;
Савва (Иоанн Михайлович Тихомиров) - епископ Харьк. и Ахтырский с 7 декабря 1874 по 23 апреля 1879;
Иустин (Иоанн Охотин) - епископ Харьк. и Ахтырский с 23 апреля 1879 по 15 сентября 1882;
Амвросий (Алексей Иосифович Ключкарев) - епископ Харьк. и Ахтырский с 22 сентября 1882 (архиепископ с 1887) по 3 сентября 1901;
Флавиан (Николай Николаевич Городецкий) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 1 ноября 1901 по 1 февраля 1903;
Арсений (Александр Дмитриевич Брянцев) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 8 февраля 1903 по 28 апреля 1914;
Антоний (Алексей Павлович Храповицкий) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 14 мая 1914 (митрополит с 29 ноября 1917) по июль 1918;
Нафанаил (Никодим Захарьевич Троицкий) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с апреля 1920 по 24 августа 1922; формально этот титул сохранялся за ним до 1927;
Константин (Константин Григорьевич Дьяков) - епископ Сумской, управлял Харьк. епархией с 21 сентября 1924 (архиепископ с 1927, митрополит Харьк. с 18 мая 1932) по 1935; с 1936 - митрополит Киевский и экзарх Украины;
Иннокентий (Иннокентий Алексеевич Летяев) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с 17 февраля 1935 по 26 июля 1936;
Иннокентий (Борис Дмитриевич Тихонов) - архиепископ Харьк. и Ахтырский с января 1937 по 2 июня 1937;
Александр (Александр Феофанович Петровский) - архиепископ Харьк. и Ахтырский со 2 июня 1937 по 28 июля 1938;
Стефан (Стефан Максимович Проценко) - архиепископ Харьк. и Богодуховский с 5 июня 1945 (митрополит с 12 февраля 1959) по 6 октября 1960;
Нестор (Никита Арсеньевич Тугай) - епископ Харьк. и Богодуховский с 16 марта 1961 по 30 марта 1964;
Леонид (Илья Христофорович Лобачев) - архиепископ Харьк. и Богодуховский с 30 марта 1964 по 28 июля 1967;
Леонтий (Иван Афанасьевич Гудимов) - епископ Харьк. и Богодуховский с 7 октября 1967 (архиепископ с 1968г.) по 1 декабря 1970;
Никодим (Николай Степанович Руснак) - архиепископ Харьк. и Богодуховский с 10 декабря 1970 по 18 марта 1984;
Ириней (Иван Петрович Середний) - архиепископ Харьк. и Богодуховский с 28 марта 1984 по 15 сентября 1989; Никодим (Николай Степанович Руснак) - митрополит Харьк. и Богодуховский с 15 сентября 1989 по настоящее время.