В 1439 г. на соборе православного и католического духовенства во Флоренции была заключена уния (лат. - единение) церквей восточной и западной. Православная церковь сохраняла свои обряды, но признавала все католические догматы и главенство папы римского. Константинопольский патриарх, идя на уступки, надеялся получить от католического запада помощь в борьбе против турецких завоевателей, под ударами которых рушилась Византийская империя.
В то время, когда в Константинополе только готовились к собору, на Руси был назначен митрополитом человек, выдающийся по образованию, грек по национальности – Исидор. Приехав в Москву, Исидор вскоре отправился на Флорентийский собор, одним из инициаторов и организаторов которого он был. Подписав унию, обласканный папою, он вернулся в Москву, объявил о состоявшемся соглашении с католической церковью. В Москве унии не приняли. Исидор был взят под стражу, затем ухитрился бежать в Литву, откуда перебрался в Италию.
Союз с католическим Западом не помог Византии в борьбе с завоевателями. В 1453 г. Константинополь был взят турками. Византийская империя прекратила свое существование.
Все эти события середины 15 в. имели важные последствия для дальнейшей истории Русской православной церкви.
В 1458 г. духовенство западных русских земель, входивших в состав польско-литовского государства, признало митрополитом сторонника Флорентийской унии, ставленника папы римского Григория. В северо-восточных землях власть его не признали, по-прежнему считая главой Русской православной церкви избранного собором епископов митрополита Иону. Таким образом, Русская православная церковь в 1458 г. раскололась на две митрополии: юго-западную (киевскую), глава которой назначался из Константинополя; и Московскую, где складывается новый порядок самостоятельного избрания митрополитов, которые начинают именоваться «Московскими и Всея Руси», отмечая тем самым начало нового, московского периода русской митрополии. Объединение Московской и Киевской митрополий произойдет только после воссоединения Украины с Россией.