Сын боярина В. Ф. Скопина-Шуйского, Михаил с ранних лет был приближен к царскому двору. Около 1604 г., пожалован в стольники, при Лжедмитрии провозглашен "великим мечником". В правление Василия Шуйского, приходившегося ему дальним родственником, как воевода участвует в сражениях с Иваном Болотниковым. В 1608 г. ведет переговоры со шведами, обещавшими военную помощь Василию Шуйскому. Сам Скопин-Шуйский выступает из Новгорода в мае 1609 г., наносит поражение войскам сторонников Лжедмитрия II и в марте 1610 г. освобождает Москву от осады. Но в апреле Михаил Васильевич внезапно умирает. По слухам, он мог быть отравлен на пиру по поводу крестин у князя И. М. Воротынского своей кумой - женой Дмитрия Ивановича Шуйского. Причиной устранения Скопина-Шуйского (если отравление не было случайным) могла быть зависть бездарного полководца Дмитрия Шуйского: молодой воевода, одержавший ряд побед и освободивший Москву, приобрел в столице огромный авторитет.