(уничтожена).
На набережную Москвы-реки недалеко от Краснохолмского моста еще в 1960-е гг. выходил Пупышевский переулок, и на его углу высились руины храма святителя Николая в Пупышах. Такое странное, но очень старомосковское название объясняют, как место низменное, бугристое, а на самом высоком бугре — на «пупыше» — стояла Никольская церковь. Пойма заливалась водой, а на «пупыш» вода доходила только в самые большие паводки. С 1788 г. на Никольском храме делали отметки высоты подъема воды во время больших паводков.
Деревянная церковь на этом месте известна с середины XVI века. Ее заменили на каменную в 1686—1690 гг. Тогда возвели главный объем храма, трапезную и притвор. Главный престол освятили в честь Смоленской иконы Божией Матери, в трапезной были устроены Никольский и Ильинский приделы. Колонны, восьмигранные окна, сухарчатые карнизы, наличники, завершенные волютами, пояс кокошников и купола с глухими восьмигранными барабанами — типичный декор конца XVII века — украшали храм. В 1731—1735 гг. на средства суконного фабриканта В.П. Щеголина церковь перестроили, тогда же возвели основную часть колокольни. В 1764 г. Ильинский придел переосвятили в честь иконы Божией Матери «Утоли моя печали». Основная святыня храма — чтимый образ Богородицы «Утоли моя печали» — была принесена в Москву казаками в 1640 г. В память о бывшем от иконы 25 января 1760 г. знамении, в этот день был установлен ее праздник, тогда же были составлены служба и акафист. Благоговейное почитание святого образа особенно проявилось во время чумы 1771 г. Вероятно, из-за ветхости первоначальной иконы с нее в XVIII в. сделали копию, поставленную сначала в приделе церкви Николы в Пупышах, а потом, в советское время, перенесенную в церковь Николы в Кузнецах.
Крупные переделки были произведены в 1846—1850 гг. По проекту архитектора П.П. Буренина перестроили колокольню, украсили лепными раковинами кокошники, сделали каменные ворота и ажурную чугунную ограду. В 1875 г. при храме открыли богадельню на двенадцать женщин на средства, оставленные по завещанию купца И.Ф. Бакланова. Тогда же появилась церковноприходская школа.
В 1931 г. Никольский храм закрыли и приспособили под общежитие работников конного транспорта, а в 1934 г. его начали разбирать на стройматериалы для Метростроя. Разобрали верх церкви и колокольню и бросили. В 1933—1935 гг. набережную реконструировали. Здесь построили многоэтажные жилые дома, изменившие облик всего района. Остатки Никольского храма оказались во дворе домов № 40 и № 42 и были уничтожены к 1970 г.